Агапов – воспитанник «Рубина». В прошлом сезоне выступал за «Нефтехимик» на правах арендованного футболиста. Он провел 21 матч в рамках ФНЛ (1 гол).
Агапов заключил со «Спартаком» контракт, который рассчитан до 31 мая 2022 года. В настоящее время Илья находится в расположении молодежной сборной России. Позднее Агапов начнет подготовку к сезону со второй командой «Спартака».
